30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0071 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 
137 aa  276  8e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  49.21 
 
 
129 aa  111  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  48.74 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  47.66 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  46.28 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  45.05 
 
 
139 aa  95.9  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  9.5126e-07  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  47.66 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  47.66 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  42.48 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  44.14 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  40.3 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  45.05 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  45.92 
 
 
214 aa  86.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  40.87 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  44.95 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  39.09 
 
 
135 aa  82.8  1e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  38.26 
 
 
148 aa  81.6  3e-15  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  36.04 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  39.13 
 
 
148 aa  80.1  8e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  36.61 
 
 
127 aa  79.7  1e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  34.55 
 
 
135 aa  79  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  37.39 
 
 
148 aa  78.2  3e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  39.84 
 
 
129 aa  77.4  6e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  45.68 
 
 
212 aa  76.6  1e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  41.18 
 
 
131 aa  75.5  2e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  35.04 
 
 
151 aa  75.5  2e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  38.26 
 
 
134 aa  75.1  3e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  36.28 
 
 
134 aa  71.6  3e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  34.67 
 
 
236 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  33.33 
 
 
245 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>