30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3199 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  76.06 
 
 		 323 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  72.62 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  72.73 
 
 		 329 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  71.89 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  71.3 
 
 		 331 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  60.91 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  34.23 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  35.28 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  33.44 
 
 		 276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  26.64 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  36.05 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  37.36 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  32.82 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  36.78 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  37.93 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  34.02 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  29.1 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  23.68 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  26.95 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.99 
 
 		 265 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  37.8 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  36.05 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  33.71 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  25.4 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  28.8 
 
 		 274 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30.86 
 
 		 230 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>