207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0320 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  100 
 
 
320 aa  634    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  61.02 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  51.27 
 
 
310 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  55.71 
 
 
336 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  46.65 
 
 
336 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  55.87 
 
 
300 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  48.41 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  48.46 
 
 
316 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  45.28 
 
 
321 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  49.06 
 
 
304 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  50 
 
 
304 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  48.86 
 
 
317 aa  222  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  50.48 
 
 
309 aa  222  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  48.87 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  45.78 
 
 
305 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  52.27 
 
 
310 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  45.83 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  50 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  47.02 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  50.18 
 
 
317 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  48.71 
 
 
315 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  47.27 
 
 
311 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  46.38 
 
 
330 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  46.86 
 
 
291 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  46.58 
 
 
300 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  37.79 
 
 
301 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  49.29 
 
 
295 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  46.84 
 
 
315 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  38.49 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  40.88 
 
 
306 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  39.31 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  35.12 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  36.33 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  43.82 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  46.15 
 
 
316 aa  178  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  46.79 
 
 
336 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  38.2 
 
 
297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  41.03 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  37.41 
 
 
303 aa  172  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  38.4 
 
 
296 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  33.44 
 
 
307 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  37.38 
 
 
426 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  44.33 
 
 
314 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  35.51 
 
 
305 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  35.14 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  37.08 
 
 
355 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  39.1 
 
 
304 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  34.7 
 
 
304 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  41.73 
 
 
303 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  44.23 
 
 
314 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  45.42 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  45.42 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  37.84 
 
 
302 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  34.68 
 
 
370 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  40.82 
 
 
317 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  31.39 
 
 
304 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  35.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.05 
 
 
300 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  34.93 
 
 
305 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  35 
 
 
315 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  32.5 
 
 
292 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  40.82 
 
 
323 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  32.5 
 
 
292 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  35.71 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  32.5 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  35.84 
 
 
315 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.11 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  35.84 
 
 
315 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  29.17 
 
 
292 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  34.96 
 
 
303 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  37.46 
 
 
297 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  32.33 
 
 
294 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  43.27 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.32 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  36.52 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  33.46 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  39.78 
 
 
265 aa  145  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  36.52 
 
 
315 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  35.69 
 
 
302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  31.14 
 
 
293 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  41.16 
 
 
290 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  32.46 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  30.45 
 
 
294 aa  139  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.65 
 
 
304 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.65 
 
 
304 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  33.83 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  40.38 
 
 
310 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  35.05 
 
 
303 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  30.42 
 
 
292 aa  136  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  35.45 
 
 
292 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  33.33 
 
 
296 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  38.49 
 
 
307 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  33.83 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.06 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  30.52 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  32.97 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  39.54 
 
 
284 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  32.42 
 
 
297 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  30.71 
 
 
281 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  30.71 
 
 
281 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>