More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4257 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.03 
 
 
495 aa  740  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.62 
 
 
492 aa  688  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.38657e-09 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.48 
 
 
491 aa  650  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.18 
 
 
512 aa  705  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.19 
 
 
478 aa  714  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.55 
 
 
519 aa  674  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.48 
 
 
491 aa  647  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.44 
 
 
491 aa  793  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.58 
 
 
490 aa  793  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
486 aa  660  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.82 
 
 
485 aa  706  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.1 
 
 
489 aa  756  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.48 
 
 
491 aa  650  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.49 
 
 
476 aa  720  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.12 
 
 
496 aa  729  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 
487 aa  661  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.74 
 
 
486 aa  737  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.57 
 
 
493 aa  659  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.3 
 
 
489 aa  758  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 
478 aa  733  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.75 
 
 
496 aa  729  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.34 
 
 
485 aa  755  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.1 
 
 
489 aa  756  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.27 
 
 
476 aa  701  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.61 
 
 
485 aa  711  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  68.02 
 
 
506 aa  681  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  74.95 
 
 
488 aa  744  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  70.02 
 
 
495 aa  687  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  72.65 
 
 
476 aa  735  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  72.65 
 
 
475 aa  727  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
498 aa  1025  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  72.08 
 
 
483 aa  724  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  72.29 
 
 
485 aa  724  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.18 
 
 
494 aa  662  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.32 
 
 
478 aa  750  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  72.65 
 
 
475 aa  722  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  71.61 
 
 
478 aa  704  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  71.82 
 
 
484 aa  714  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.03 
 
 
492 aa  687  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  70.7 
 
 
498 aa  701  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  75.46 
 
 
489 aa  752  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  63.82 
 
 
512 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.21 
 
 
471 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.21 
 
 
471 aa  598  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.41 
 
 
496 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.89 
 
 
465 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62 
 
 
472 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
471 aa  594  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.04 
 
 
480 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
466 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.05 
 
 
466 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.63 
 
 
480 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.89 
 
 
466 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.54 
 
 
472 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.24 
 
 
480 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.13 
 
 
473 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 
479 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
473 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
471 aa  583  1e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.5 
 
 
466 aa  582  1e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.5 
 
 
468 aa  583  1e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.34 
 
 
468 aa  583  1e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.71 
 
 
468 aa  584  1e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.5 
 
 
468 aa  583  1e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.96 
 
 
471 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.91 
 
 
466 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.16 
 
 
466 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.8 
 
 
465 aa  577  1e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.91 
 
 
466 aa  577  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.29 
 
 
474 aa  575  1e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.45 
 
 
473 aa  573  1e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.71 
 
 
479 aa  572  1e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.25 
 
 
468 aa  572  1e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.25 
 
 
509 aa  574  1e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.54 
 
 
479 aa  573  1e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  59.8 
 
 
482 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61 
 
 
477 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.64 
 
 
463 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.51 
 
 
462 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.91 
 
 
481 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  59.02 
 
 
470 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.04 
 
 
469 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.17 
 
 
467 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.38 
 
 
476 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.83 
 
 
472 aa  564  1e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
474 aa  561  1e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.02 
 
 
472 aa  562  1e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.12 
 
 
472 aa  563  1e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.46 
 
 
476 aa  563  1e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.79 
 
 
464 aa  562  1e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.13 
 
 
472 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.17 
 
 
471 aa  560  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.29 
 
 
476 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.99 
 
 
472 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.38 
 
 
463 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.29 
 
 
474 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.3 
 
 
475 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09982e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
469 aa  561  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.99 
 
 
472 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.2 
 
 
472 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>