34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2438 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  100 
 
 		 174 aa  347  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  42.69 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  40.83 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  37.65 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  28.4 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  36.26 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  29.41 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  33.72 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  33.13 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  29.7 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  27.59 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  32.58 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  30.25 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  33.52 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.36 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  36.67 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  40.35 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  20.42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  29.24 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.67 
 
 		 156 aa  44.3  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.11 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  33.8 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.1 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  29.83 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.66 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  37.66 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  40 
 
 		 148 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.56 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  34.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0743  flavodoxin  30.14 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>