33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1740 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  53.52 
 
 
322 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  51.5 
 
 
338 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  49.09 
 
 
314 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  55.31 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  52.85 
 
 
323 aa  215  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  52.85 
 
 
347 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  51 
 
 
323 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  44.17 
 
 
319 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  44.17 
 
 
319 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  50 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  48.29 
 
 
318 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  37.19 
 
 
398 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  48.29 
 
 
318 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  40.45 
 
 
309 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  37.95 
 
 
357 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  43.33 
 
 
290 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  42.8 
 
 
254 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  41.84 
 
 
303 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  43.84 
 
 
276 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  36.75 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  24.62 
 
 
307 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  31.62 
 
 
315 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  32.11 
 
 
259 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
1087 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  25.82 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  32.24 
 
 
464 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  28.36 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  28.36 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  35.79 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
1071 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  29.25 
 
 
465 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  25.87 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>