19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1644 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  33.91 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  41.04 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  43.53 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  38.69 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  32.96 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  32.93 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  41.22 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  28.18 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  29.58 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  31.32 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  28.8 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  32.61 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  30.38 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  33.98 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  28.3 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  26.29 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  28.93 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>