37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0514 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0514  peptidase U32  100 
 
 		 388 aa  802    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000252039  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2571  peptidase U32  55.73 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.746078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1027  peptidase U32  32.46 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3233  peptidase U32  31.94 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2114  peptidase U32  28.23 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1527  peptidase U32  26.63 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00774566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1040  Collagenase and related protease-like protein  26.98 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1305  hypothetical protein  26.76 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.122473  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0684  peptidase U32  24.8 
 
 		 343 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  29 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  24.23 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  22.22 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  24.9 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  24.44 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  21.28 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  25.24 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  22.9 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  23.95 
 
 		 839 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  26.98 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  23.32 
 
 		 847 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  23.5 
 
 		 835 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  22.34 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  22.34 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  23.92 
 
 		 783 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  29.41 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  26.98 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.48 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  23.53 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  29.13 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  22.41 
 
 		 886 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  26.19 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  19.77 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  26.98 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  26.47 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  23.04 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  24.75 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  21.05 
 
 		 471 aa  42.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>