67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2571 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2571  peptidase U32  100 
 
 
379 aa  784    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.746078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0514  peptidase U32  55.73 
 
 
388 aa  449  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000252039  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1027  peptidase U32  30.39 
 
 
405 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3233  peptidase U32  29.35 
 
 
405 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2114  peptidase U32  27.59 
 
 
412 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1527  peptidase U32  30.41 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00774566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1040  Collagenase and related protease-like protein  29.9 
 
 
360 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1305  hypothetical protein  26.62 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.122473  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  27.39 
 
 
783 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  24.03 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  23.31 
 
 
835 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  23.4 
 
 
847 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  25.75 
 
 
783 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  23.47 
 
 
835 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3753  peptidase U32  23.85 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  22.61 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  23.14 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  24.15 
 
 
818 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  23.72 
 
 
839 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  23.83 
 
 
886 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  23.08 
 
 
822 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0684  peptidase U32  24.9 
 
 
343 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  21.29 
 
 
696 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  23.68 
 
 
838 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  22.73 
 
 
783 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  23.1 
 
 
783 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  22.71 
 
 
805 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  22.41 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  24.78 
 
 
722 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  22.65 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  20.51 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  22.65 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  25.37 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  24.89 
 
 
767 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  21.79 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  21.25 
 
 
654 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  21.25 
 
 
654 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  24.55 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  21.25 
 
 
654 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  21.25 
 
 
654 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  21.25 
 
 
654 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2987  peptidase U32  26.56 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  23.53 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  24.79 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  27.78 
 
 
467 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  24.79 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  27.41 
 
 
792 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  24.27 
 
 
817 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  22.86 
 
 
419 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  27.78 
 
 
471 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  24.79 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  24.48 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  22.14 
 
 
790 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  21.46 
 
 
790 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2702  hypothetical protein  30.43 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0231204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27440  hypothetical protein  22.04 
 
 
286 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.928344  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  22.41 
 
 
832 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  22.83 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  20.51 
 
 
653 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  22.97 
 
 
746 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1895  hypothetical protein  23.6 
 
 
255 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  hitchhiker  0.000366813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  28.32 
 
 
746 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  23.75 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  25.93 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  25.93 
 
 
458 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  21.9 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  23.46 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>