42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1527 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1527  peptidase U32  100 
 
 
347 aa  723    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00774566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2114  peptidase U32  35.27 
 
 
412 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2571  peptidase U32  30.41 
 
 
379 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.746078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1027  peptidase U32  27.32 
 
 
405 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3233  peptidase U32  27.04 
 
 
405 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0514  peptidase U32  26.63 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000252039  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1040  Collagenase and related protease-like protein  25.55 
 
 
360 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1305  hypothetical protein  27.62 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.122473  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  23.21 
 
 
428 aa  52.8  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  25.68 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  25.65 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  25.42 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  26.37 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  25.17 
 
 
411 aa  49.7  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  24.18 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1034  peptidase U32  26.77 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  26.43 
 
 
716 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  21.28 
 
 
817 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  27.5 
 
 
548 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  25.77 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  25.77 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  25.77 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  22.56 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  25.77 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  24.86 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  25.77 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  25.77 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  25.77 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  23.03 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  27.53 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  23.33 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  26.62 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  21.86 
 
 
426 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  25.15 
 
 
653 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  25.15 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  25.15 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  23.53 
 
 
396 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  25.15 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  25.15 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  25.15 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  25.57 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  24.72 
 
 
337 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>