More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0127 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 413 aa  825    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  72.36 
 
 		 423 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.86 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.78 
 
 		 425 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.86 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.02 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.03 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.42 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.43 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.95 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.82 
 
 		 428 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.69 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.9 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.91 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.07 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.64 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.16 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  48.82 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.06 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.21 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  48.82 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.12 
 
 		 416 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.2 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.59 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>