More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2981 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2981  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3087  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  96.3 
 
 
189 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  95.77 
 
 
189 aa  363  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3996  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.71 
 
 
188 aa  333  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2197  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  82.16 
 
 
196 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36411  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1156  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  81.08 
 
 
195 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0023  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  79.29 
 
 
178 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2541  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.93 
 
 
181 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3093  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
180 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4024  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.8 
 
 
182 aa  213  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3863  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.57 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.419035  normal  0.0674381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.57 
 
 
180 aa  210  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1597  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.02 
 
 
181 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.896706  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1985  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 
178 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 
178 aa  204  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0995  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 
178 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.634062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3192  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
179 aa  141  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
180 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
176 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
176 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
176 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
176 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
176 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
181 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
181 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
181 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
180 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
174 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
177 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  40.94 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
186 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
181 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
178 aa  135  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
181 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
182 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
182 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
176 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
190 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
177 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
180 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
179 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
175 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
183 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
183 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
175 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
180 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
176 aa  130  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 
178 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
176 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>