More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1597 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1597  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
181 aa  353  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.896706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2981  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.02 
 
 
189 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0023  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2197  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
196 aa  214  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36411  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.45 
 
 
189 aa  214  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3087  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.45 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2541  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.58 
 
 
181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3093  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1156  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3996  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.57 
 
 
188 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3863  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 
180 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.419035  normal  0.0674381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0995  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
178 aa  205  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.634062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 
180 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.47 
 
 
178 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1985  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.47 
 
 
178 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4024  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.54 
 
 
182 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3192  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
184 aa  168  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
179 aa  158  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
182 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
184 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
180 aa  153  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
189 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
180 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
180 aa  151  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  151  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
183 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  150  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  150  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
174 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
177 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
184 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
183 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  147  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  147  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
176 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
179 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
182 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
182 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
183 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
175 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
183 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
175 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
175 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
178 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
178 aa  142  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
178 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
181 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
183 aa  141  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  141  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
183 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
180 aa  140  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
190 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
176 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
179 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>