76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1790 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  96.59 
 
 		 176 aa  321  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  96.02 
 
 		 176 aa  320  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  72.16 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  77.27 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  61.2 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  61.88 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  65.81 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  55.17 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  59.62 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  52.87 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  50.93 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  47.16 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  44.07 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  46.59 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  49.1 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  55.33 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  46.45 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  44.71 
 
 		 184 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  46.45 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  45.68 
 
 		 178 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  45.39 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  45.81 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  44.16 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  40.99 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  46.3 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  39.74 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  32.96 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  39.16 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  34.12 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  38.29 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  39.46 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  37.58 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  33.92 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  38.52 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  32.87 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.91 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  31.21 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  31.21 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  28.37 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  25.36 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  29.79 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  30.2 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  27.66 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.97 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  28.86 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  28.86 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  26.74 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  34.67 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  22.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  28.79 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  26.17 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  26.35 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  24.5 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  27.68 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00902  hypothetical protein  31.07 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  30.2 
 
 		 144 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  24.5 
 
 		 142 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>