250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1932 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1932  NADPH:quinone reductase-related Zn-dependent oxidoreductase  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00401032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  66.33 
 
 
327 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.82 
 
 
327 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.33 
 
 
327 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  64.29 
 
 
327 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  63.59 
 
 
330 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.78 
 
 
328 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.24 
 
 
327 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.73 
 
 
327 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  61.73 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.29 
 
 
327 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
327 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.76 
 
 
327 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.37 
 
 
345 aa  248  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  62.76 
 
 
326 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.2 
 
 
327 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 
328 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.24 
 
 
328 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.78 
 
 
338 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.69 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.18 
 
 
328 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60 
 
 
331 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.27 
 
 
338 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.2 
 
 
327 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  60.2 
 
 
327 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.22 
 
 
327 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.71 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.22 
 
 
325 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  58.67 
 
 
327 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
328 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  60.62 
 
 
327 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  59.69 
 
 
327 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  59.69 
 
 
327 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.69 
 
 
328 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.27 
 
 
328 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  59.18 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.71 
 
 
329 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  59.69 
 
 
327 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  58.67 
 
 
327 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  60 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  60.2 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.69 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  62.89 
 
 
338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.14 
 
 
327 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  63.27 
 
 
328 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.8 
 
 
334 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
327 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  61.14 
 
 
738 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  58.67 
 
 
328 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 
333 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  58.67 
 
 
328 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.38 
 
 
329 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  58.67 
 
 
326 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  56.63 
 
 
328 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  58.16 
 
 
328 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.25 
 
 
325 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  55.1 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  57.65 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  51.27 
 
 
327 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.49 
 
 
329 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.12 
 
 
329 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.22 
 
 
327 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.61 
 
 
325 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.65 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  57.95 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  56.12 
 
 
327 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  55.1 
 
 
326 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  55.1 
 
 
326 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.69 
 
 
328 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.57 
 
 
332 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.1 
 
 
327 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  54.59 
 
 
327 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.33 
 
 
336 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.38 
 
 
328 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.06 
 
 
334 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.55 
 
 
332 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  52.04 
 
 
332 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.06 
 
 
325 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.55 
 
 
325 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.91 
 
 
330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06860  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.82 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0708364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  53.06 
 
 
326 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.81 
 
 
331 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  56.12 
 
 
331 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  53.69 
 
 
337 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.31 
 
 
336 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.31 
 
 
336 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 
328 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.76 
 
 
325 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  49.24 
 
 
330 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.06 
 
 
325 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  49.24 
 
 
330 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.54 
 
 
326 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  57.14 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.14 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  57.14 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  57.14 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  57.14 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  56.55 
 
 
324 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  56.55 
 
 
324 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>