More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4601 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 545 aa  953    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 545 aa  953    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 545 aa  953    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 487 aa  954    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 487 aa  954    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 487 aa  954    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  52.59 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.4 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.4 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.12 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.56 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.56 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  35.03 
 
 		 539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.61 
 
 		 509 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.11 
 
 		 536 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.87 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 		 518 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.97 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.46 
 
 		 520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.16 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.89 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  52.51 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.31 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.01 
 
 		 378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  35.19 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.41 
 
 		 186 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.59 
 
 		 353 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  23.98 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  49.25 
 
 		 229 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.9 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.12 
 
 		 297 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  42.6 
 
 		 284 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3978  transposase  49.51 
 
 		 107 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.719199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.27 
 
 		 176 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  30.3 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  47.95 
 
 		 118 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  36.03 
 
 		 122 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  34.07 
 
 		 198 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  40.19 
 
 		 103 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  23.23 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.58 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  40.85 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  30.93 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  43.24 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  33.1 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  50 
 
 		 153 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.28 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7029  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0984  transposase  42.65 
 
 		 81 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000283789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  36.56 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  36.56 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.11 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.11 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2360  transposase  37.5 
 
 		 106 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00308299  hitchhiker  0.00959569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  31.87 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  31.87 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  31.87 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  31.87 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1730  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.97 
 
 		 391 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0842  transposase  24.21 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  33.73 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0167  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.67 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1755  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0739  hypothetical protein  43.94 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  28.27 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  30.43 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2410  hypothetical protein  27.66 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  31.76 
 
 		 342 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  31.76 
 
 		 342 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  28.27 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  27.72 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9617  transposase  35.16 
 
 		 230 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  30.49 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>