299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0023 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000214158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0063  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.362704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0023  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881928  decreased coverage  0.000601016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0018  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.045305  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0850  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.031083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0013  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>