More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2122 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.59 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.32 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.62 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  36.81 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.25 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.81 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.98 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.88 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.48 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.62 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.17 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.22 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  34.19 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.43 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.48 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.43 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  34.48 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  34.48 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  35.38 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.72 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  34.75 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  35.17 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.75 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.75 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.1 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  28.79 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.97 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.52 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  36.13 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.4 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.83 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.09 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  30.83 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.97 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  29.19 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.25 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.23 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.59 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  29.63 
 
 
265 aa  62.4  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>