More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1739 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  57.69 
 
 
109 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  56.73 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  56.44 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  52.88 
 
 
111 aa  113  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  54.81 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  54.81 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  52.43 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  53.92 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  56.44 
 
 
109 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  56.44 
 
 
109 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  53.85 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  55.45 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  56.44 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  53.47 
 
 
120 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  55.45 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  53.47 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  53.47 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  52 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  51.96 
 
 
107 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  52.48 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  53.47 
 
 
109 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  54.46 
 
 
109 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  55.45 
 
 
109 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  52.48 
 
 
111 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  52.48 
 
 
109 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  52.48 
 
 
111 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  54.55 
 
 
108 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  51.96 
 
 
108 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  51.52 
 
 
99 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  47.96 
 
 
107 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  55.21 
 
 
110 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  53.47 
 
 
110 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  52.94 
 
 
109 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  53 
 
 
104 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  50.5 
 
 
103 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  50 
 
 
106 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  50.5 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  51.02 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  50.96 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  52.53 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  54.55 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  51.92 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47.27 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47.27 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  49.51 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  50.96 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  50.96 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  50.96 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  45.1 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  47.17 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.51 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  46 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  45 
 
 
101 aa  94  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  49 
 
 
104 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  46.39 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  49.49 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  49.49 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  51.52 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  49.02 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  46 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  46.46 
 
 
106 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  46 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  42.72 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>