33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0040 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  91.21 
 
 
398 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  766    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  65.82 
 
 
398 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  54.04 
 
 
400 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  27.54 
 
 
389 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.23 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.79 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  26.16 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  24.09 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.08 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  27.12 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.36 
 
 
403 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  24.51 
 
 
422 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.9 
 
 
413 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  22.34 
 
 
409 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.54 
 
 
413 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  25.38 
 
 
466 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  23.7 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  26.15 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  23.24 
 
 
505 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  22.86 
 
 
506 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  21.45 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  24.75 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  22.5 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  27.72 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.85 
 
 
506 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  21.97 
 
 
500 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.12 
 
 
503 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  23.27 
 
 
503 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23 
 
 
518 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  23.94 
 
 
495 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  24.59 
 
 
505 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.72 
 
 
499 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>