More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2217 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  100 
 
 
149 aa  301  1e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  68.75 
 
 
160 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  68.53 
 
 
160 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  3.16146e-08  unclonable  2.511e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  68.28 
 
 
154 aa  203  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  71.63 
 
 
154 aa  203  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  70.63 
 
 
153 aa  201  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  69.5 
 
 
154 aa  201  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  69.5 
 
 
154 aa  201  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  66.44 
 
 
148 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  68.28 
 
 
151 aa  199  1e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  69.01 
 
 
161 aa  198  2e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  69.01 
 
 
155 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  69.72 
 
 
162 aa  197  4e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  68.31 
 
 
151 aa  197  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  67.59 
 
 
150 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  67.14 
 
 
142 aa  197  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  66.21 
 
 
153 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  65.52 
 
 
154 aa  193  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  67.38 
 
 
151 aa  193  8e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  64.79 
 
 
145 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.68272e-07  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  63.76 
 
 
148 aa  191  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  64.67 
 
 
155 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  65.99 
 
 
159 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  65.75 
 
 
161 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  67.15 
 
 
154 aa  190  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  67.15 
 
 
154 aa  190  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  67.15 
 
 
154 aa  190  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  63.09 
 
 
148 aa  190  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  64.75 
 
 
148 aa  189  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  64.14 
 
 
154 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  63.89 
 
 
158 aa  189  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  65.47 
 
 
147 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  65.47 
 
 
147 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  65.47 
 
 
147 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  61.9 
 
 
157 aa  188  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  67.39 
 
 
155 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  63.83 
 
 
146 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  63.12 
 
 
148 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  65.96 
 
 
151 aa  187  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  61.74 
 
 
149 aa  187  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  63.12 
 
 
148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  64.29 
 
 
148 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  62.07 
 
 
151 aa  187  6e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  60.54 
 
 
151 aa  186  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  64.54 
 
 
153 aa  186  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  63.57 
 
 
148 aa  186  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  63.04 
 
 
147 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  65.47 
 
 
147 aa  185  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  63.31 
 
 
148 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  63.31 
 
 
148 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  65.96 
 
 
154 aa  185  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  65.47 
 
 
147 aa  185  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  65.93 
 
 
154 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  66.91 
 
 
153 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  61.74 
 
 
155 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  65.93 
 
 
154 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  60.27 
 
 
156 aa  184  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  64.29 
 
 
147 aa  184  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  60.14 
 
 
158 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.04244e-08  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  62.16 
 
 
156 aa  184  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  61.38 
 
 
148 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  65.94 
 
 
155 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  65.94 
 
 
155 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  65.94 
 
 
155 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  65.94 
 
 
155 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  65.94 
 
 
155 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  61.22 
 
 
155 aa  183  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  63.31 
 
 
147 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.65419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  62.59 
 
 
150 aa  183  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  64.79 
 
 
166 aa  183  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  60.54 
 
 
157 aa  183  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  5.90654e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  62.14 
 
 
154 aa  183  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  60.69 
 
 
148 aa  182  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  58.9 
 
 
148 aa  182  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  61.7 
 
 
149 aa  182  1e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  59.46 
 
 
161 aa  182  2e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.74708e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  58.78 
 
 
156 aa  182  2e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.6103e-08  hitchhiker  1.32763e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  58.78 
 
 
185 aa  182  2e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.80033e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  62.68 
 
 
155 aa  181  2e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  57.89 
 
 
151 aa  182  2e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  58.39 
 
 
150 aa  182  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  60.84 
 
 
155 aa  181  2e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  66.42 
 
 
164 aa  181  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  64.29 
 
 
155 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  62.96 
 
 
159 aa  181  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  59.46 
 
 
158 aa  181  4e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.63424e-06  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  57.05 
 
 
156 aa  181  4e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.21835e-05  decreased coverage  9.99459e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>