23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0071 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  33.75 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  32.02 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0842  hypothetical protein  29.56 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  28.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  29.49 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.69 
 
 		 437 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.69 
 
 		 436 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  30.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  28.19 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  38.71 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  24.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  24.86 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29.57 
 
 		 423 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  25.95 
 
 		 480 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  25.93 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  32.43 
 
 		 465 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  28.79 
 
 		 445 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.83 
 
 		 473 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>