More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0058 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  100 
 
 
334 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  64.31 
 
 
368 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  64.59 
 
 
345 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  62.19 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  66.12 
 
 
360 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  62.9 
 
 
354 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  64.14 
 
 
360 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  64.14 
 
 
362 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  66.12 
 
 
361 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  64.14 
 
 
359 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  63.84 
 
 
351 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  62.9 
 
 
344 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  60.94 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  64.14 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  61.46 
 
 
333 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  64.14 
 
 
322 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  60.31 
 
 
340 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  60.62 
 
 
354 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  64.14 
 
 
339 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  63.31 
 
 
345 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  64.14 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  65.13 
 
 
345 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  64.14 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  64.14 
 
 
336 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  64.14 
 
 
336 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  64.14 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  61.09 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  62.38 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  64.47 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  65.88 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  60.45 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  58.54 
 
 
350 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  60.84 
 
 
350 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  58.59 
 
 
353 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  58.57 
 
 
364 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  60.83 
 
 
340 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  64.14 
 
 
342 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  58.58 
 
 
352 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  62.66 
 
 
340 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  63.16 
 
 
339 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  59.18 
 
 
342 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  61.83 
 
 
329 aa  391  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  63.16 
 
 
339 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  60 
 
 
369 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  63.16 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  63.49 
 
 
339 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  63.16 
 
 
339 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  61.13 
 
 
350 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  59.55 
 
 
350 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  57.76 
 
 
330 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  59.55 
 
 
356 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  57.91 
 
 
374 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  57.79 
 
 
346 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  57.79 
 
 
346 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  57.79 
 
 
346 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  62.46 
 
 
338 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  57.79 
 
 
346 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  66.09 
 
 
325 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  58.12 
 
 
346 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  57.56 
 
 
346 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  58.82 
 
 
346 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  59.18 
 
 
340 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  58.25 
 
 
352 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1475  biotin synthase  59.42 
 
 
350 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  57.88 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  57.1 
 
 
367 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  60.45 
 
 
336 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  59.05 
 
 
341 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  57.56 
 
 
345 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  59.94 
 
 
356 aa  381  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  57.51 
 
 
345 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  60 
 
 
350 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  62.74 
 
 
336 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  56.91 
 
 
345 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  57.81 
 
 
331 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  60 
 
 
349 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  60.91 
 
 
335 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  55.56 
 
 
337 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  56.63 
 
 
352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  56.63 
 
 
352 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  55.99 
 
 
352 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  59.63 
 
 
356 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  57.14 
 
 
345 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  56.13 
 
 
351 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  59.42 
 
 
347 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>