103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0038 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0033  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04005  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006368  lppt35  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt35  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  94.64 
 
 		 462 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0021  tRNA-Cys  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  91.94 
 
 		 71 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0026  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.285214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3170t  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0586308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0018  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0856  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.569143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0001  tRNA-Cys  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0009  tRNA-Cys  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705692  normal  0.0935108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0012  tRNA-Cys  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0384692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0015  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0002  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0044  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0054  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05684  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0030  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60570  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  95 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0040  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0022  tRNA-Cys  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0021  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191059  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0693  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0702  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0836  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.20631e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02745  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05672  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05678  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05683  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0031  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna119  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000033796  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna001  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna004  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna006  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248027  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0242  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0030  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0039  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00215479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6040  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Cys-2  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0528288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2880  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1743  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2453  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2828  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0221727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2765  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0332395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2825  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1776  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00638418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0068  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.505859  hitchhiker  0.00111076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04829  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0034  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  0.65843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0036  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0579773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3267  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3176t  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000794009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0070  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0038  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0049  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0852361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0044  tRNA-Cys  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0037  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt05  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0953188  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0096  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.830071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0055  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0032  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.423302  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0582  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0063  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0048  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0059965  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0072  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0032  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0454547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0068  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.080231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.292986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0034  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348473  normal  0.348376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0075  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>