20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0096 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0096  tRNA-Cys  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.830071  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  89.39 
 
 
72 bp  75.8  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0006  tRNA-Cys  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0001  tRNA-Cys  94.44 
 
 
74 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.536129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0063  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4584  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0077  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0077  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0075  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0034  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0068  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.080231  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0032  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0454547  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0072  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0017  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0582  tRNA-Cys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0683  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000909207  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0650  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0032  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392433  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt05  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>