16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0006 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0006  tRNA-Cys  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0150  tRNA-Cys  88.89 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.977632  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0096  tRNA-Cys  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.830071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0650  tRNA-Cys  92.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0683  tRNA-Cys  92.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000909207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0023  tRNA-Cys  92.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0021  tRNA-Cys  92.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0021  tRNA-Cys  92.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0030  tRNA-Cys  94.44 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0001  tRNA-Cys  90 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.536129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0017  tRNA-Cys  86.27 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  84.29 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0007  tRNA-Cys  86.96 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  85.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  85.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>