72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_R0015 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0031  tRNA-Cys  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931849  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0042  tRNA-Cys  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178543  normal  0.586426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0039  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000510746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0039  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00256025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0042  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000509201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0045  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0629972  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16770  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196388  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0023  tRNA-Cys  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125865  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15500  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0042  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0630788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0029  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0031  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16740  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186273  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0035  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0030  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0031  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13880  tRNA-Cys  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0819816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0028  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259946  normal  0.0657688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0036  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0040  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00117723  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0026  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.619128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0025  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.083387  hitchhiker  0.000430374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0025  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0041  tRNA-OTHER  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0027  tRNA-Cys  89.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0036  tRNA-Cys  89.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601784  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0040  tRNA-Cys  89.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.29176  normal  0.285834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0034  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000888056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0036  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.381254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0035  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0025  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10760  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0456446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0022  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0022  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0650599  normal  0.0120275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  89.8 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04005  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006368  lppt35  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt35  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0021  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0026  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.285214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  87.04 
 
 		 462 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0028  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0033  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0012  tRNA-Cys  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0384692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0001  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0009  tRNA-Cys  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705692  normal  0.0935108 
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0044  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0054  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.77119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>