44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_R0044 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0044  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3170t  tRNA-Cys  92.45 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0586308  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0242  tRNA-Cys  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05684  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0087  tRNA-Cys  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0090  tRNA-Cys  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0037  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.659023  normal  0.593785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0021  tRNA-Cys  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0015  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R49  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA44  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0803701  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t37  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453949  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna001  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna119  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000033796  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna004  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna006  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0073  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000369177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2056  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000925021  hitchhiker  0.000585084 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05672  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05683  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02745  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4237  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.48815e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0040  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0065  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000190442  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05678  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0090  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00230411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0045  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0596059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3267  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0150  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.977632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60570  tRNA-Cys  86.27 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna22  tRNA-Cys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0030  tRNA-Cys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0022  tRNA-Cys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.924194  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0693  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0038  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0049  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0852361  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0702  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0037  tRNA-Cys  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0836  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.20631e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>