215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0024 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0088  tRNA-His  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000578887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t44  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA32  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.922886  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41330  tRNA-His  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908879  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0019  tRNA-His  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.248393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60220  tRNA-His  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  88.41 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0069  tRNA-His  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000556793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0054  tRNA-His  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186869  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0034  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0040  tRNA-His  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0115548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0057  tRNA-His  87.18 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  94 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  94 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tHis01  tRNA-His  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000397081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0066  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308433  normal  0.0175019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0064  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0431987 
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R52  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R54  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0044  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.1121e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0035  tRNA-His  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246336  normal  0.0312371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0058  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  hitchhiker  0.000424792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0056  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441531  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t51  tRNA-His  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297022  normal  0.0342999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t53  tRNA-His  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266756  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0144  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00158556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0101  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839897  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0048  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000560154  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0026  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0142  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0015  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2558  tRNA-His  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2560  tRNA-His  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt35  tRNA-His  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3788  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4649  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0008  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.958243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0095  tRNA-His  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0119  tRNA-His  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0557096  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-His-1  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  85.92 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0106  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.83328e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5088  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t29  tRNA-His  88.89 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.158046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4162  tRNA-His  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4711  tRNA-His  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.57467e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0054  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0132  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0143  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0020  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000738141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0085  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240103  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4162  tRNA-His  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0021  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000629735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0115  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444508  normal  0.0132879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0115  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000103194  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0040  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000863654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0029  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0124  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0169657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0028  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000239191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0118  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1548  tRNA-His  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>