13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0054 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0054  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186869  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00486  tRNA-His  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00488  tRNA-His  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3098t  tRNA-His  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3100t  tRNA-His  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000111916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna019  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000572511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna021  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0088  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000578887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>