23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2074 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  100 
 
 
630 aa  1295    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  31.72 
 
 
640 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  28.22 
 
 
623 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  31.65 
 
 
359 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  27.32 
 
 
679 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  32.19 
 
 
641 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  27.92 
 
 
802 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  27.81 
 
 
657 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  25.86 
 
 
1065 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.03 
 
 
914 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  32.46 
 
 
1011 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  32.48 
 
 
748 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.55 
 
 
766 aa  84.7  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  28.09 
 
 
624 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  28.03 
 
 
979 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  26.45 
 
 
1157 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  34.34 
 
 
429 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.1 
 
 
1224 aa  63.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  24.36 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  31.03 
 
 
310 aa  60.8  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  30.23 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  28.69 
 
 
522 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  28.69 
 
 
522 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>