More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4701 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  78.73 
 
 
276 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  77.78 
 
 
295 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  70.68 
 
 
269 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  70.31 
 
 
305 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  63.18 
 
 
281 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.62162e-06  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  61.92 
 
 
288 aa  337  1e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  63.14 
 
 
258 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  62.16 
 
 
256 aa  327  2e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  64.2 
 
 
258 aa  321  9e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  61.57 
 
 
320 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  59.32 
 
 
304 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  58.98 
 
 
301 aa  314  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  60.16 
 
 
304 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  58.96 
 
 
305 aa  314  1e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  58.78 
 
 
322 aa  312  4e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  58.43 
 
 
304 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  58.43 
 
 
304 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  58.63 
 
 
324 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  56.42 
 
 
292 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  56.13 
 
 
308 aa  309  3e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  61.54 
 
 
310 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  56.87 
 
 
305 aa  308  6e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  63.22 
 
 
300 aa  308  6e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  59.04 
 
 
324 aa  308  6e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  61.41 
 
 
310 aa  308  7e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  60 
 
 
316 aa  307  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  66.21 
 
 
393 aa  306  2e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  61.83 
 
 
307 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  61 
 
 
314 aa  305  5e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  59.6 
 
 
316 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  57.83 
 
 
308 aa  305  8e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  60.08 
 
 
308 aa  304  9e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  57.09 
 
 
307 aa  304  9e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  60.08 
 
 
308 aa  304  9e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  60.08 
 
 
308 aa  304  9e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  56.55 
 
 
309 aa  304  9e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  59.6 
 
 
316 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  59.6 
 
 
316 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  59.6 
 
 
316 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  62.17 
 
 
513 aa  304  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  57.83 
 
 
305 aa  304  1e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  59.68 
 
 
308 aa  303  2e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  61.16 
 
 
305 aa  303  2e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  58.3 
 
 
304 aa  303  2e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  56.77 
 
 
304 aa  303  2e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  57.6 
 
 
337 aa  302  4e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  53.03 
 
 
318 aa  302  5e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  56.59 
 
 
359 aa  300  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  60.17 
 
 
304 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  55.64 
 
 
310 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  57.43 
 
 
308 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  66.82 
 
 
300 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  60.61 
 
 
326 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  58.97 
 
 
364 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  58.8 
 
 
316 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  63.59 
 
 
331 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.71683e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  55.72 
 
 
306 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  56.18 
 
 
338 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  58.2 
 
 
297 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  59.74 
 
 
326 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  62.27 
 
 
405 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  59.31 
 
 
305 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  57.36 
 
 
283 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  59.4 
 
 
357 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  57.03 
 
 
285 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  59.32 
 
 
298 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  51.66 
 
 
309 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  55 
 
 
302 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  57.48 
 
 
280 aa  295  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  55.42 
 
 
314 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  2.30323e-07  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  62.67 
 
 
391 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  61.64 
 
 
365 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  55.39 
 
 
316 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  56.35 
 
 
280 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  61.36 
 
 
340 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  58.12 
 
 
303 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  58.55 
 
 
367 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  54.69 
 
 
336 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  58.9 
 
 
274 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  54.69 
 
 
340 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  58.47 
 
 
273 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  59.58 
 
 
279 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  58.3 
 
 
277 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  53.52 
 
 
338 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  57.78 
 
 
369 aa  289  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13156e-08 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  55.04 
 
 
278 aa  288  5e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  56.43 
 
 
304 aa  288  5e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  56.4 
 
 
274 aa  288  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  57.78 
 
 
263 aa  288  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  57.38 
 
 
272 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  58.72 
 
 
327 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  56.36 
 
 
301 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  60.08 
 
 
270 aa  286  3e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  59.4 
 
 
383 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  56.96 
 
 
272 aa  285  6e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  58.7 
 
 
273 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  56.25 
 
 
294 aa  284  1e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  56.25 
 
 
294 aa  284  1e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  56.25 
 
 
294 aa  284  1e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>