47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1195 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 226 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  97.35 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  89.82 
 
 		 226 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  67.4 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  53.98 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  46.03 
 
 		 243 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  44.83 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  41.96 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  35.78 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  30.67 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  30 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  32.3 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  36 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  32.08 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  32.13 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  40.72 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  27.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.17 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  31.98 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  26.11 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  27.47 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  29.34 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  22.75 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  22.75 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  31.72 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  22.91 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  20.89 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.98 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.22 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  31.28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  24.77 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  37.14 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  32 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  21.19 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  30.05 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  27.72 
 
 		 666 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  24.35 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  30.48 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  28.44 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>