123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0082 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
368 aa  733  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  97.57 
 
 
219 aa  407  1e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.41 
 
 
211 aa  175  1e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.94 
 
 
212 aa  173  3e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.71 
 
 
184 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.41 
 
 
183 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.87 
 
 
210 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.61 
 
 
214 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.33 
 
 
214 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.06 
 
 
209 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.42 
 
 
260 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.74 
 
 
251 aa  148  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.03 
 
 
270 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.02 
 
 
270 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  55.12 
 
 
264 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.84 
 
 
253 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.17 
 
 
269 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.25 
 
 
168 aa  137  3e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.48 
 
 
190 aa  131  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.4 
 
 
142 aa  119  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.6 
 
 
142 aa  118  1e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.61 
 
 
139 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
257 aa  72.8  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  33.15 
 
 
293 aa  72  1e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  33.13 
 
 
330 aa  71.2  3e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  4.24807e-09  hitchhiker  9.91217e-06 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  36.64 
 
 
418 aa  70.5  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  39.81 
 
 
411 aa  70.1  6e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  31.28 
 
 
361 aa  69.7  7e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  37.61 
 
 
408 aa  67.4  4e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  34.09 
 
 
568 aa  66.2  9e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.74874e-05  hitchhiker  6.23924e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  31.39 
 
 
354 aa  64.3  3e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  35.61 
 
 
419 aa  64.7  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.37 
 
 
144 aa  64.3  3e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  36.19 
 
 
575 aa  64.7  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  33.08 
 
 
588 aa  63.9  4e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  33.1 
 
 
344 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.38 
 
 
247 aa  63.9  5e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.38 
 
 
170 aa  62  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  36.19 
 
 
537 aa  61.6  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.4 
 
 
332 aa  61.2  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  34.45 
 
 
493 aa  60.8  3e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
250 aa  61.2  3e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  31.1 
 
 
349 aa  60.5  5e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
187 aa  60.5  5e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  33.61 
 
 
503 aa  59.3  1e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.85 
 
 
257 aa  58.9  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 
309 aa  59.3  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
177 aa  58.2  3e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  57.8  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.2 
 
 
205 aa  56.6  6e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  36.19 
 
 
519 aa  55.8  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.66 
 
 
171 aa  55.8  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
155 aa  55.1  2e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  41.25 
 
 
520 aa  54.7  3e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.91 
 
 
206 aa  54.7  3e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  34.71 
 
 
503 aa  54.7  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  42.11 
 
 
455 aa  53.1  8e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  42.11 
 
 
496 aa  52.8  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  35.14 
 
 
536 aa  52  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.06 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  30.47 
 
 
186 aa  51.6  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.71 
 
 
235 aa  51.6  2e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.84 
 
 
475 aa  51.6  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.59 
 
 
230 aa  51.2  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
295 aa  50.8  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.92 
 
 
376 aa  50.4  5e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  27.94 
 
 
186 aa  50.4  5e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  29.69 
 
 
186 aa  50.1  6e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.87 
 
 
349 aa  50.1  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.19 
 
 
300 aa  49.7  8e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 
303 aa  49.7  9e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  27.21 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.69 
 
 
186 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.89 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  4.97106e-11  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.33 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.48074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 
142 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8626  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.77 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.45 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  27.13 
 
 
153 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.29 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  26.29 
 
 
314 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.94 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0493  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.92 
 
 
362 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5330  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.21 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104787  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.97 
 
 
215 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.21 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  26.36 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  39.02 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.08 
 
 
171 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.98 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  27.97 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44 
 
 
156 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66539e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>