More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0049 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  98.02 
 
 
556 aa  1057  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  77.7 
 
 
556 aa  755  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  81.77 
 
 
556 aa  822  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  100 
 
 
556 aa  1078  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  82.7 
 
 
551 aa  811  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  56.69 
 
 
565 aa  574  1e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  57.49 
 
 
572 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  56.29 
 
 
599 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  56.47 
 
 
576 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  40.52 
 
 
557 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  34.13 
 
 
560 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  37.15 
 
 
571 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.33 
 
 
569 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.94 
 
 
588 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  33.95 
 
 
578 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.33 
 
 
569 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  34.4 
 
 
572 aa  246  1e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0765  sulphate transporter  38.7 
 
 
573 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.284221  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  32.17 
 
 
565 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  33.27 
 
 
573 aa  236  1e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  34.87 
 
 
574 aa  234  2e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  37.15 
 
 
583 aa  234  2e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  33.77 
 
 
584 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  36.32 
 
 
556 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  33.82 
 
 
566 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  33.45 
 
 
559 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.27 
 
 
590 aa  223  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.61 
 
 
626 aa  222  2e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.14 
 
 
575 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  35.26 
 
 
591 aa  220  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.32 
 
 
585 aa  219  8e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  32.65 
 
 
590 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  30.35 
 
 
575 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  31.9 
 
 
575 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.94 
 
 
588 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  33.14 
 
 
576 aa  215  1e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  33.82 
 
 
569 aa  216  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  36.91 
 
 
570 aa  215  2e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.04 
 
 
568 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  31.82 
 
 
573 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  30.54 
 
 
568 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  30.54 
 
 
568 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.94 
 
 
580 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  31.82 
 
 
550 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28.78 
 
 
567 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.98 
 
 
571 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  34 
 
 
582 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  31.5 
 
 
595 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  33.6 
 
 
590 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  32.72 
 
 
592 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.77 
 
 
573 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.64 
 
 
558 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  29.72 
 
 
566 aa  202  1e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.25 
 
 
583 aa  202  1e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  32.6 
 
 
570 aa  201  4e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.32 
 
 
585 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  32.96 
 
 
588 aa  200  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  30.36 
 
 
585 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  30.36 
 
 
585 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  30.36 
 
 
585 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  30.36 
 
 
585 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  1.94119e-07 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  31.41 
 
 
597 aa  198  2e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  32.38 
 
 
576 aa  198  2e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  33.33 
 
 
569 aa  198  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  29.8 
 
 
703 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.31 
 
 
596 aa  197  5e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  30.18 
 
 
585 aa  197  5e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4635  sulfate transporter  34.06 
 
 
578 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  30.52 
 
 
570 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  29.78 
 
 
703 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.91 
 
 
578 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.95 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.47 
 
 
605 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.21 
 
 
579 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.8 
 
 
574 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.74 
 
 
574 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  27.71 
 
 
580 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  30.65 
 
 
576 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  31.2 
 
 
587 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.67 
 
 
620 aa  194  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  33.05 
 
 
570 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  32.76 
 
 
570 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  32.75 
 
 
570 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.32 
 
 
586 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  31.53 
 
 
577 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.21 
 
 
592 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  31.67 
 
 
570 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  31.03 
 
 
600 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  30.36 
 
 
585 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  33.05 
 
 
565 aa  190  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  30.18 
 
 
585 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  32.63 
 
 
567 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  30.18 
 
 
585 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  27.98 
 
 
608 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  31.02 
 
 
590 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>