More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0662 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  100 
 
 
440 aa  882  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  71.92 
 
 
442 aa  635  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  71.69 
 
 
442 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  73.43 
 
 
430 aa  631  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  66.74 
 
 
442 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  68.33 
 
 
447 aa  562  1e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  67.65 
 
 
442 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  64.25 
 
 
470 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  54.3 
 
 
441 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  54.2 
 
 
441 aa  438  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  54.2 
 
 
441 aa  438  1e-122  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  50.8 
 
 
440 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  54.3 
 
 
441 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  54.42 
 
 
441 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  50.91 
 
 
438 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  53.42 
 
 
447 aa  417  1e-115  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  53.51 
 
 
441 aa  416  1e-115  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.06 
 
 
438 aa  418  1e-115  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  50.57 
 
 
442 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  50.92 
 
 
442 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
448 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 
448 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  49.07 
 
 
442 aa  399  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  49.77 
 
 
447 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  51.16 
 
 
447 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  49.44 
 
 
444 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  49.42 
 
 
423 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  47.82 
 
 
421 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  47.71 
 
 
422 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  46.47 
 
 
437 aa  335  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  43.62 
 
 
467 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  46.31 
 
 
435 aa  328  1e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  48.83 
 
 
412 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  47.02 
 
 
424 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  47 
 
 
432 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  46.79 
 
 
424 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  42.33 
 
 
453 aa  312  8e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  48.02 
 
 
422 aa  307  2e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  42.33 
 
 
397 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 
437 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  41.81 
 
 
443 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  36.78 
 
 
434 aa  266  6e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 
435 aa  266  8e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  40.72 
 
 
435 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  35.07 
 
 
429 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  35.68 
 
 
442 aa  229  6e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 
426 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.85 
 
 
427 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 
425 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.91 
 
 
412 aa  198  1e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
418 aa  198  1e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
418 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
425 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.48 
 
 
431 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.34 
 
 
424 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.78 
 
 
424 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
429 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.01 
 
 
432 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  31.74 
 
 
416 aa  184  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 
424 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 
428 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
420 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
428 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.42 
 
 
438 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.76 
 
 
466 aa  181  3e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.2 
 
 
427 aa  181  3e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.63 
 
 
433 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.8 
 
 
431 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  32.33 
 
 
422 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 
424 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
461 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  32.51 
 
 
434 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
443 aa  175  1e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 
425 aa  175  2e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
441 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  37.12 
 
 
403 aa  173  6e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  36.83 
 
 
441 aa  173  6e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
451 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
422 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.76883e-07  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 
425 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
432 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 
436 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
435 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.04 
 
 
381 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
435 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 
428 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  30.7 
 
 
424 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 
428 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.04 
 
 
435 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
436 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.04 
 
 
437 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  32.13 
 
 
422 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  33.93 
 
 
440 aa  167  3e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  40.06 
 
 
386 aa  167  3e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  37.28 
 
 
427 aa  167  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
437 aa  166  6e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  37.17 
 
 
425 aa  166  6e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  29.46 
 
 
457 aa  166  7e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.99 
 
 
470 aa  165  1e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 
430 aa  166  1e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>