58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0725 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  100 
 
 
134 aa  276  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  65.41 
 
 
135 aa  184  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  51.13 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.7 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  49.23 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  52.31 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  42.75 
 
 
149 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  45.8 
 
 
144 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  41.22 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  44.27 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.51 
 
 
148 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  53.08 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.67 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.62 
 
 
156 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.27 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.04 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.85 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.6 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.98 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.15 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.38 
 
 
129 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.39 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.38 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  43.85 
 
 
135 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.86 
 
 
176 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  40.46 
 
 
150 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  39.1 
 
 
142 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.79 
 
 
146 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.16 
 
 
145 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  37.98 
 
 
148 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 
152 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  42.31 
 
 
129 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.62 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.7 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.64 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 
151 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.3 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.06 
 
 
145 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.64 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  41.61 
 
 
184 aa  88.2  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.09 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.64 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  34.11 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.34 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  35.34 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.58 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  39.77 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.63 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  27.2 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.24 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.78 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  26.27 
 
 
130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  24.79 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.36 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>