More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0013 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0013  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  86.09 
 
 		 116 aa  201  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  75.65 
 
 		 119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0900  nitrogen regulatory protein P-II  71.3 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  59.13 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.96 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.64 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.75 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  41.96 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  42.86 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.96 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  42.86 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  42.86 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>