More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1881 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  59.06 
 
 
269 aa  298  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.343545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2086  ABC-type sulfate transport system, permease component  41.74 
 
 
282 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00102691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
268 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
256 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
255 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  36.65 
 
 
280 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000135254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  35.09 
 
 
270 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  34.48 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.63 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  34.55 
 
 
287 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  39.49 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  34.4 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  38.38 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  31.08 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.86 
 
 
225 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 
271 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
230 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  33.77 
 
 
271 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.15 
 
 
279 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  42.86 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  32.4 
 
 
273 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.27 
 
 
278 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.46 
 
 
277 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.74 
 
 
276 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
275 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.58 
 
 
278 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1781  tungstate/molybdate transport system permease protein  36.05 
 
 
255 aa  105  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.07 
 
 
306 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.96 
 
 
298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.96 
 
 
298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.96 
 
 
298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  38.82 
 
 
293 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.08 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.08 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.96 
 
 
284 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.29 
 
 
269 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.71 
 
 
300 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  39.75 
 
 
238 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.07 
 
 
278 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.96 
 
 
273 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.03 
 
 
284 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  31.14 
 
 
266 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  34.4 
 
 
288 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  29.77 
 
 
288 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  30.7 
 
 
266 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
299 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2216  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.1 
 
 
288 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
273 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1628  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.2 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.621307  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.05 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.8 
 
 
283 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.11 
 
 
318 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.05 
 
 
306 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.62 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.57 
 
 
275 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.05 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.6 
 
 
278 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  30.38 
 
 
277 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.86 
 
 
288 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.8 
 
 
283 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.05 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.49 
 
 
289 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.05 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
265 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 
286 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4713  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.48 
 
 
350 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324829  normal  0.541075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3332  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.52 
 
 
296 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845298  normal  0.297479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  31.98 
 
 
267 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
232 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  34.74 
 
 
338 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.84 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  32.85 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1544  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.46 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.53 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.14 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1798  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0366388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  35.79 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  38.27 
 
 
228 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30 
 
 
277 aa  99  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30 
 
 
277 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
305 aa  99  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.565856  normal  0.919623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30 
 
 
277 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.64 
 
 
283 aa  98.6  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.8 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  38.46 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  29.82 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>