29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0416 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  100 
 
 
310 aa  610  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  34.42 
 
 
318 aa  175  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  34.71 
 
 
319 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  30.54 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  27.65 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  28.03 
 
 
323 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  27.4 
 
 
319 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  28.14 
 
 
312 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  27.33 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  30.92 
 
 
378 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  27.27 
 
 
329 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  27.63 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  25.61 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  27.69 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  27.97 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  27.97 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  27.59 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  30.93 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  26.85 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  25.43 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  24.27 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  23.75 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  25.94 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  24.91 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  24.14 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  24.33 
 
 
457 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  22.19 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  25.89 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  25.53 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>