More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0033 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  52.38 
 
 
321 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  43.29 
 
 
448 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 
355 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
313 aa  148  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 
336 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  38.97 
 
 
299 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
321 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
450 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  31.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.87 
 
 
528 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
353 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
391 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
305 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
229 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  31.31 
 
 
531 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.06 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
220 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.38 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.11 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.61 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  27.63 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.64 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  30.43 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  27.72 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.57 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  27.81 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.29 
 
 
305 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
340 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.86 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.8 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  30.88 
 
 
749 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.38 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  27.88 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>