259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1755 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
156 aa  309  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  87.1 
 
 
188 aa  267  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  76.16 
 
 
155 aa  233  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4026  hypothetical protein  72.73 
 
 
158 aa  230  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.39 
 
 
159 aa  227  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46740  hypothetical protein  70.78 
 
 
158 aa  226  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932046  decreased coverage  0.000000141029 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.74 
 
 
152 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.74 
 
 
156 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.08 
 
 
152 aa  223  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3616  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.45 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  64.47 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  64.47 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  64.47 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  64.47 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  64.47 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.28 
 
 
155 aa  215  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  64.47 
 
 
152 aa  213  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  63.82 
 
 
155 aa  206  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4680  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.13 
 
 
160 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1123  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.08 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.435066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0303  hypothetical protein  63.16 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.13 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0219  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.33 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303284 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1464  putative ebsC protein  59.87 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1661  putative ebsC protein  59.87 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2579  YbaK  59.87 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2443  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  59.87 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0316  putative ebsC protein  59.87 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129099  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0284  putative ebsC protein  59.21 
 
 
160 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.663414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0881  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  59.21 
 
 
202 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0525  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 
152 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1396  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.13 
 
 
160 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0580  ebsC protein, putative  57.89 
 
 
256 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0527  hypothetical protein  56.58 
 
 
132 aa  173  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0664  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.97 
 
 
155 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0491998  hitchhiker  0.00288999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.76 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.45 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.58 
 
 
157 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0019  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.76 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  37.24 
 
 
156 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2368  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  38.56 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.13 
 
 
154 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  33.77 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34 
 
 
157 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.04 
 
 
151 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.81 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.6 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.17 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  38.21 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.17 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.21 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.98 
 
 
248 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.43 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.66 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.88 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  33.06 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.59 
 
 
251 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.92 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0335  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.39 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.1 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34 
 
 
201 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  31.78 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  35.51 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  33.04 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  34.58 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  36.52 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  33.64 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0706  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.09 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  31.86 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  28.93 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.69 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.67 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.89 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  35.65 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0570  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.77 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  30.94 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.48 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.41 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.35 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.08 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.8 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  40.7 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.94 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1677  hypothetical protein  42.59 
 
 
56 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.5 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  28.46 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  34.78 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.61 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  28.91 
 
 
162 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
157 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.42 
 
 
221 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.3 
 
 
162 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>