More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1505 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 66 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1878  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 		 66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  73.85 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  75.38 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 66 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4356  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.6 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.184389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 66 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 66 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 66 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  76.19 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 65 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 65 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  76.19 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.02 
 
 		 65 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 68 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  69.7 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  71.43 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  74.6 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  74.6 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  74.6 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  74.6 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  96.7  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  73.85 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  67.74 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  71.43 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  72.31 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  69.84 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 65 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4519  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 65 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  70.97 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  69.23 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 65 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>