More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0744 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  100 
 
 
394 aa  801    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  62.44 
 
 
394 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  58.52 
 
 
394 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  50.64 
 
 
395 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  48.96 
 
 
391 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  48.85 
 
 
397 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  45.36 
 
 
391 aa  368  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  46.42 
 
 
391 aa  364  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  45.9 
 
 
390 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  48.24 
 
 
393 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  44.36 
 
 
404 aa  341  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  46.35 
 
 
400 aa  339  5e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  44 
 
 
391 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  41.87 
 
 
390 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  39.47 
 
 
393 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  42.34 
 
 
390 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  39.44 
 
 
404 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  40.36 
 
 
396 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  41.04 
 
 
387 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 
399 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  40.78 
 
 
396 aa  292  7e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  40.78 
 
 
387 aa  291  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  40.78 
 
 
387 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  40.78 
 
 
387 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  40.78 
 
 
387 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  40.78 
 
 
387 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  40.73 
 
 
385 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  40.9 
 
 
382 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
387 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.42 
 
 
387 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  38.86 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  40.52 
 
 
387 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  40 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  39.84 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  38.68 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  39.84 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  39.58 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  39.58 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  38.74 
 
 
387 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  39.58 
 
 
387 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  40.79 
 
 
385 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  38.78 
 
 
407 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  39.03 
 
 
395 aa  279  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  39.43 
 
 
385 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  40.52 
 
 
400 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  42.86 
 
 
390 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  40.52 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  39.42 
 
 
380 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  39.01 
 
 
388 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 
391 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
386 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  36.88 
 
 
391 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 
384 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 
384 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  38.22 
 
 
397 aa  270  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 
385 aa  269  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  38.62 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  37.11 
 
 
398 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
398 aa  265  8e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
402 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.22 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 
410 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  38.18 
 
 
388 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  39.67 
 
 
399 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  38.64 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  37.2 
 
 
392 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
379 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 
405 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  36.34 
 
 
394 aa  256  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  34.18 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  37.87 
 
 
387 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  36.43 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  38.58 
 
 
387 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 
383 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
381 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  38.65 
 
 
380 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  35.94 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  36.2 
 
 
376 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  38.59 
 
 
393 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  37.99 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
392 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>