More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2195 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 602 aa  1221    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 602 aa  1221    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  42.55 
 
 		 645 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 		 618 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  44.54 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  41.74 
 
 		 610 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  39.57 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  41.1 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  40.1 
 
 		 678 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  39.6 
 
 		 618 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 		 636 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 618 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 618 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 618 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  38.58 
 
 		 618 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  42.08 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 		 664 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.56 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  39.6 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.93 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  40.57 
 
 		 629 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  40.57 
 
 		 629 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  39.56 
 
 		 662 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  40.4 
 
 		 629 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  38.31 
 
 		 637 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 646 aa  439  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  40.9 
 
 		 630 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.27 
 
 		 646 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  40.5 
 
 		 631 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 		 667 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.83 
 
 		 618 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  37.12 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  40.67 
 
 		 655 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 		 630 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  36.79 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  38.5 
 
 		 641 aa  432  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 		 629 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  40.17 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  40 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  39.68 
 
 		 802 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  39.5 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  36.64 
 
 		 652 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  39.9 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  39.74 
 
 		 803 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 		 631 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  39.43 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  41.44 
 
 		 636 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  39.74 
 
 		 803 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  41.44 
 
 		 636 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  39.9 
 
 		 809 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  36.52 
 
 		 636 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  39.81 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  37.58 
 
 		 634 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  39.81 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  39.81 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 703 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  38.31 
 
 		 679 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  39.81 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  40.17 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  40.35 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  39.39 
 
 		 771 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.86 
 
 		 640 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  40.55 
 
 		 627 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  39.05 
 
 		 617 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  39.4 
 
 		 617 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  39.39 
 
 		 767 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  41.18 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  40.66 
 
 		 681 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  38.87 
 
 		 761 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 765 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 643 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  39.03 
 
 		 775 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  38.71 
 
 		 800 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 765 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  39.03 
 
 		 760 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  35.92 
 
 		 637 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 		 619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  35.6 
 
 		 631 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 633 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  39.19 
 
 		 756 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>