35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0312 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  497  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  497  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  2.26241e-05 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  27.31 
 
 
288 aa  92  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  26.73 
 
 
264 aa  89  7e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  23.53 
 
 
381 aa  82  8e-15  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  32.41 
 
 
267 aa  80.9  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  29.63 
 
 
274 aa  80.1  3e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  29.33 
 
 
260 aa  77.4  2e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  77  3e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  22.83 
 
 
259 aa  76.3  4e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  28.83 
 
 
515 aa  75.9  6e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  30.91 
 
 
271 aa  74.7  1e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  26.76 
 
 
266 aa  73.6  3e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  24.7 
 
 
256 aa  73.2  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  24.79 
 
 
438 aa  73.2  4e-12  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  26.74 
 
 
258 aa  72.8  5e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  27.48 
 
 
266 aa  68.6  9e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  32.74 
 
 
266 aa  67.8  2e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  24.35 
 
 
268 aa  65.5  8e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  28.78 
 
 
278 aa  63.9  3e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  30.56 
 
 
274 aa  60.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  27.67 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  22.67 
 
 
268 aa  59.3  5e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  22.22 
 
 
268 aa  58.2  1e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  29.85 
 
 
254 aa  55.5  8e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  22.86 
 
 
480 aa  52.8  6e-06  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  22.06 
 
 
269 aa  49.3  5e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  27.61 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  29.22 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  2.09176e-06 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  24.68 
 
 
611 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  30.37 
 
 
421 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  29.01 
 
 
485 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  24.3 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  24.03 
 
 
636 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  25.45 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>