81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3114 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  77.92 
 
 		 173 aa  249  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  65.56 
 
 		 181 aa  240  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  52.27 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  53.12 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  53.12 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  53.61 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  50 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  50.63 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  49.37 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  49.35 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  49.17 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  45.98 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  47.17 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  43.02 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  44.44 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  40.72 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  44.81 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  44.16 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  44.59 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  42.21 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  44.16 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  44.59 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  44.9 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  36.63 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  40.61 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  38.18 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  34.48 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  33.53 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  39.23 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  42.18 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  38.61 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  37.41 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  37.41 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  33.54 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  34.27 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  34.75 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  35.48 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  35.21 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  34.04 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  34.56 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  38.97 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30.95 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  29.14 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  29.8 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.72 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  32.89 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  36.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  30.56 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  26.57 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2519  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  27.15 
 
 		 152 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  24.67 
 
 		 140 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  32.71 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>