280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0594 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.92 
 
 		 132 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.75 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.75 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.38 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.06 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.19 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.34 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.79 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 146 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.72 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.28 
 
 		 543 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.03 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.81 
 
 		 135 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.36 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.36 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.59 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.91 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.67 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.44 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.76 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.39 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.19 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.19 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.41 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  39.06 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.19 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.36 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.6 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.61 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.88 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.55 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.55 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.84 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.26 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.01 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.6 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.48 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.6 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.23 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.57 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.66 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.58 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.69 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.42 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.3 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.93 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.94 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.69 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  37.69 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  37.4 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.96 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>