More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0205 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  79.55 
 
 
88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  80 
 
 
87 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  78.82 
 
 
87 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  76.14 
 
 
88 aa  137  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  78.82 
 
 
87 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  76.47 
 
 
87 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  76.47 
 
 
87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  76.47 
 
 
87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  75.29 
 
 
86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  72.94 
 
 
87 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  74.12 
 
 
86 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  72.94 
 
 
86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  69.32 
 
 
88 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
85 aa  120  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  66.29 
 
 
89 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
84 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  60.23 
 
 
89 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
84 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 
86 aa  103  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  64.71 
 
 
86 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  62.96 
 
 
96 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 
86 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
91 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
87 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  61.18 
 
 
86 aa  100  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
98 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
94 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  60.98 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.76 
 
 
85 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  58.43 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  57.65 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  56.32 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  53.26 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  58.54 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  59.52 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 
86 aa  94.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  57.65 
 
 
93 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  60.49 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
102 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
84 aa  94  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
91 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 
86 aa  93.6  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  60.47 
 
 
87 aa  93.2  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
102 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  57.65 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  57.5 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
96 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  61.84 
 
 
94 aa  92  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  55.17 
 
 
84 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  54.76 
 
 
99 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  54.67 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
84 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  52.22 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  54.67 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>