146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C58 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C58  transposase  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0039  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0122  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0598  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0685  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0707  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000230067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1166  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0209729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1293  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1364  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1494  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1592  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1634  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1676  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1796  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1965  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2300  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00950484  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2329  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0962  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000493286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0992  transposase  94.74 
 
 		 86 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0284709  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B2  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D09  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.874823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0114  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000229736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1358  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.695089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0352  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1213  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.474133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1872  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0579808  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1994  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.330535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1505  transposase  93.42 
 
 		 86 aa  144  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1929  transposase  92.11 
 
 		 86 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0680  transposase  92.11 
 
 		 86 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0306806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0811  transposase  87.3 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.415253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1507  transposase IS3/IS911 family protein  47.44 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000019748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0758  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453356  hitchhiker  0.00246482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2525  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0714  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0799  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0297207  hitchhiker  0.00184796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1985  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.982856  normal  0.0748906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2828  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0762  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0302585  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1978  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2131  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1530  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000372695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1528  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000359227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2554  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1592  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000200325  unclonable  8.37308e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0764  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416197  hitchhiker  0.0022946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0256  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.103856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  37.66 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0760  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  36.36 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C03  transposase  35.06 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2223  transposase  30.49 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  32.1 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  27.38 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  27.38 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  35.44 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  32.91 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  35.44 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  35.44 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1833  transposase  46.81 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.27366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1495  transposase  36.36 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  33.75 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>